使用眼药水时眼睛刺痛可能是药物成分刺激或眼部存在损伤引起的，通常与眼药水类型、使用方法或眼部状态有关。
部分眼药水中含有防腐剂或特定药物成分，可能对敏感的眼表组织产生短暂刺激。滴眼液温度过低或滴入速度过快也可能引发不适。正常角膜表面存在轻微划痕时，药液渗透可能产生灼烧感。眼表炎症如结膜炎或角膜炎患者使用含抗菌成分的眼药水时，药物与病原体作用过程中可能出现刺痛反应。某些抗青光眼药物通过收缩瞳孔发挥作用，可能伴随短暂刺痛感。
眼部手术后伤口未完全愈合时使用眼药水，药物接触创面易引发疼痛。角膜上皮大面积缺损者使用含苯扎氯铵的眼药水可能出现明显刺激症状。对眼药水成分过敏者除刺痛外还会伴随眼睑红肿。干眼症患者泪液分泌不足时，眼药水可能破坏不稳定的泪膜结构导致刺痛。长期使用含激素眼药水者出现角膜变薄时，药物渗透性增加会加重不适感。
使用眼药水前应洗净双手并核对药品有效期。滴眼时轻拉下眼睑形成结膜囊，避免药瓶接触睫毛。滴入后闭眼按压泪囊区减少全身吸收。出现持续刺痛需停用并冲洗眼睛，携带药品包装及时就诊眼科。日常避免揉眼并保持用眼卫生，室内使用加湿器维持空气湿度。佩戴隐形眼镜者需在用药前摘除镜片，使用人工泪液可缓解轻度干眼症状。
