扁桃体炎手术后遗症主要有术后出血、感染、咽喉疼痛、味觉改变、鼻咽反流等。扁桃体切除术是治疗反复发作扁桃体炎的常见手术方式，多数患者术后恢复良好，但少数可能出现上述并发症。
术后出血是较严重的并发症，多发生在术后24小时内或术后5-7天伪膜脱落期。出血量少时可表现为唾液中带血丝，大量出血需立即就医处理。感染可能由手术创面细菌侵入引起，表现为发热、咽痛加重、颈部淋巴结肿大，需使用抗生素如阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克洛分散片等进行抗感染治疗。
咽喉疼痛为术后常见反应，与手术创伤和炎症反应有关，疼痛程度因人而异，通常持续1-2周。味觉改变多因手术影响舌咽神经分支，导致短暂性味觉异常，多数在3个月内自行恢复。鼻咽反流表现为进食时食物从鼻腔反流，与软腭功能暂时失调有关，多数在术后1个月左右逐渐改善。
术后应保持口腔清洁，使用生理盐水漱口，避免剧烈咳嗽和用力擤鼻。饮食以温凉流质或半流质为主，避免过硬、过热、辛辣刺激性食物。若出现持续高热、大量出血、呼吸困难等症状需及时就医。术后2周内避免剧烈运动，保证充足休息有助于创面愈合。
