皮脂腺囊肿手术后可能会有疤痕，具体是否留疤与个人体质、术后护理等因素有关。
皮脂腺囊肿手术属于有创操作，术后皮肤愈合过程中可能形成疤痕。疤痕的明显程度与手术切口大小、深度、缝合技术以及个人体质密切相关。部分人群属于疤痕体质，术后更容易出现增生性疤痕或瘢痕疙瘩。术后护理不当如感染、抓挠伤口等也会加重疤痕形成。医生通常会选择隐蔽部位或顺皮纹方向做切口，并使用细线精细缝合以减少疤痕。
少数情况下可能出现疤痕不明显甚至几乎不可见的情况。这多见于囊肿较小、位置表浅且非疤痕体质者。采用激光、射频等微创方式处理的小囊肿，术后恢复更快且疤痕更轻微。儿童青少年因皮肤修复能力强，术后疤痕往往较成年人更不明显。
术后应保持伤口清洁干燥，避免剧烈运动导致伤口张力增大。拆线后可使用硅酮类疤痕凝胶预防增生，严格防晒半年以防止色素沉着。若出现疤痕增生、红肿瘙痒等症状，需及时就医进行激光或药物注射等干预。饮食上多补充维生素C和优质蛋白，促进皮肤修复。
