牙齿正畸可能存在的危害主要有牙根吸收、牙龈萎缩、牙齿松动、颞下颌关节紊乱、口腔溃疡等。正畸治疗需在专业医生指导下进行，严格遵循医嘱可降低风险。
正畸过程中牙齿移动可能导致牙根外表面轻微吸收，通常无明显症状且可通过X线检查发现。重度吸收可能影响牙齿稳定性，需定期复查牙根情况。临床常用盐酸米诺环素软膏辅助控制炎症，配合使用复方氯己定含漱液维护口腔卫生。
矫治器长期刺激或清洁不足易引发牙龈退缩，表现为牙根暴露、冷热敏感。使用软毛牙刷和冲牙器可减少机械刺激，辅以丁硼乳膏局部涂抹。若伴随牙龈红肿出血，需联合甲硝唑口颊片控制感染。
生理性松动属于正畸正常反应，牙齿在牙槽骨内改建过程中会出现1-2毫米活动度。病理性松动多与咬合创伤有关，需调整矫治力度。必要时采用玻璃离子水门汀暂时固定，并口服布洛芬缓释胶囊缓解疼痛。
咬合关系改变可能引发关节弹响或张口受限，常见于深覆颌矫正初期。可通过颌垫治疗配合红外线理疗改善，严重者需注射醋酸泼尼松龙注射液。日常应避免咀嚼硬物及大张口动作。
矫治器摩擦黏膜导致创伤性溃疡高发，表现为圆形糜烂面伴灼痛感。推荐使用重组人表皮生长因子凝胶促进愈合，疼痛明显时可含服利多卡因胶浆。进食后及时用西吡氯铵含片消毒创面。
正畸期间应保持每日三次巴氏刷牙法清洁，使用含氟牙膏预防龋齿。避免食用粘性过大或过硬食物防止托槽脱落，定期进行牙周洁治控制菌斑。出现持续疼痛、托槽松动等情况需及时复诊，矫治结束后需长期佩戴保持器防止复发。儿童患者家长需监督刷牙并协助使用牙线，成人患者戒烟限酒有助于牙周健康维护。
