飞秒激光手术一般安全性较高，但少数情况下可能出现干眼症、眩光、角膜混浊等后遗症。飞秒激光手术主要用于矫正近视、远视和散光，通过激光精确切削角膜组织改变屈光度。术后恢复情况与个体差异、术前检查完善度及术后护理密切相关。
干眼症是较常见的术后反应，由于手术暂时影响角膜神经调节，可能导致泪液分泌减少。症状包括眼部干涩、异物感，多数在3-6个月内逐渐缓解。日常可使用人工泪液缓解，严重时需进行睑板腺按摩或脉冲光治疗。眩光现象多发生在夜间，表现为灯光周围出现光晕，这与瞳孔大小和切削区设计有关，通常术后半年会明显改善。避免夜间驾驶并遵医嘱使用促进角膜修复的眼药水有助于减轻症状。
角膜混浊属于较严重但罕见的并发症，表现为角膜层间出现云雾状混浊，可能影响视力清晰度。这种情况多与个体愈合反应异常相关，需通过二次手术或角膜交联术处理。极少数患者可能出现角膜扩张，表现为术后数年角膜持续变薄变形，需通过角膜胶原交联或移植手术干预。术前严格筛查圆锥角膜风险因素可显著降低该并发症概率。
术后需严格遵医嘱使用抗生素和抗炎眼药水，避免揉眼及游泳等可能感染的行为。定期复查角膜地形图和视力情况，术后1周、1个月、3个月、6个月需进行系统检查。保持用眼卫生，避免长时间电子屏幕使用，室内可佩戴防蓝光眼镜。饮食注意补充维生素A和Omega-3脂肪酸，如胡萝卜、深海鱼等食物有助于角膜修复。出现持续眼红、疼痛或视力骤降等异常症状时应立即就医。
