病毒性脑炎可能会复发，但复发概率较低。病毒性脑炎是由病毒感染引起的脑实质炎症，多数患者在及时治疗后不会复发，少数患者可能因免疫力低下、病毒潜伏感染或治疗不彻底等原因出现复发。
病毒性脑炎复发与患者自身免疫状态密切相关。免疫功能正常者经规范抗病毒治疗后，病毒可被完全清除，复发风险极低。部分患者使用阿昔洛韦注射液、更昔洛韦胶囊等抗病毒药物后，症状可完全缓解。但免疫功能受损者如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者，病毒可能未被彻底清除，潜伏于神经节内，当免疫力下降时可重新激活导致复发。这类患者需定期监测免疫功能，必要时延长抗病毒疗程。
少数特殊病毒如单纯疱疹病毒1型感染后，可能长期潜伏于三叉神经节，当机体受凉、疲劳或应激时，病毒沿神经轴突逆行至脑部引发复发性脑炎。临床表现为头痛、发热、精神行为异常等症状再次出现。对于此类患者，医生可能建议长期小剂量维持抗病毒治疗，使用伐昔洛韦片等药物预防复发。儿童患者复发时症状可能不典型，家长需密切关注其精神状态变化。
病毒性脑炎患者康复后应保持规律作息，避免过度劳累。饮食上适当增加优质蛋白如鱼肉、蛋类摄入，有助于免疫修复。可进行适度有氧运动如散步、太极拳，但避免剧烈运动。若出现头痛、发热等可疑症状，应及时复查脑脊液和脑电图。免疫功能低下者需在医生指导下定期复查，必要时进行预防性抗病毒治疗。
