高位肛周脓肿的复发概率相对较高，主要与术后创面处理不当、感染控制不彻底、基础疾病未纠正等因素有关。
高位肛周脓肿因位置深、脓腔范围大，手术引流后创面愈合时间长，若换药不及时或操作不规范，可能导致坏死组织残留或引流不畅，形成死腔。术后未遵医嘱使用抗生素控制感染，或过早停用药物，可能使残留细菌再次繁殖。糖尿病患者血糖控制不佳、克罗恩病患者肠道炎症持续存在等基础疾病，也会显著增加复发风险。这类患者术后需延长抗感染治疗周期，并配合原发病管理。
少数复发与解剖变异有关，如脓肿内口定位不准确导致术中遗漏，或存在多发性瘘管未彻底清除。术后过早进行剧烈运动、久坐压迫创面等行为可能影响愈合。部分患者因疼痛恐惧排便，粪便堆积压迫创面也可能诱发感染。反复发作的高位脓肿可能进展为复杂性肛瘘，需通过磁共振或超声检查明确瘘管走向后行二次手术。
建议术后每日用高锰酸钾溶液坐浴，保持创面清洁干燥。定期复查肛门镜观察愈合情况，出现红肿热痛需及时就医。控制血糖及炎症性肠病活动期症状，避免辛辣刺激饮食，保证膳食纤维摄入预防便秘。术后3个月内避免骑自行车、深蹲等增加肛周压力的动作。
