黑芝麻和白芝麻的营养价值各有侧重，黑芝麻的钙、铁含量更高，白芝麻的蛋白质和脂肪含量略优。两种芝麻均富含不饱和脂肪酸、维生素E及膳食纤维，具体选择需根据营养需求决定。
黑芝麻的矿物质含量显著高于白芝麻，每100克黑芝麻含钙量超过白芝麻3倍，铁含量约为白芝麻的2倍，适合需要补钙、补铁的人群。黑芝麻中的黑色素含花青素类物质，具有一定抗氧化作用。白芝麻的蛋白质含量比黑芝麻高10％-15％，脂肪总量略多且单不饱和脂肪酸比例更高，对心血管健康有益。两种芝麻的维生素E含量相当，均有助于延缓细胞氧化。
从微量元素角度，黑芝麻的锌、硒等含量略占优势，而白芝麻的磷、镁等元素更丰富。黑芝麻更适合贫血、骨质疏松者食用，白芝麻则更利于肌肉合成和能量补充。两种芝麻的膳食纤维含量接近，均能促进胃肠蠕动。特殊人群需注意：黑芝麻可能加重湿热体质者的症状，白芝麻过量食用可能增加油脂摄入。
日常食用建议将两种芝麻交替或混合使用，每日总量控制在15-20克。可研磨后加入豆浆或粥品以提高吸收率，避免高温油炸破坏营养。胃肠功能较弱者宜少量多次食用，对芝麻过敏者应禁用。若存在特殊疾病需控制脂肪摄入，应在营养师指导下调整用量。
