滴眼药水后眼睛疼可能是正常的药物刺激反应，也可能与药物过敏、眼部损伤等因素有关。
部分眼药水含有防腐剂或特定药物成分，使用时可能产生短暂刺痛感。这种刺激通常出现在滴入后10-30秒内，伴随轻微灼热或异物感，1-2分钟内可自行缓解。常见于含硼酸、苯扎氯铵等成分的抗生素类眼药水如左氧氟沙星滴眼液，或抗疲劳类眼药水如复方门冬维甘滴眼液。此时无须特殊处理，但需避免揉眼，使用前将药液冷藏至20℃左右可减轻刺激。
若疼痛持续超过5分钟或出现眼睑肿胀、结膜充血加重、视物模糊等症状，需考虑异常反应。可能因角膜上皮损伤未愈时接触刺激性药物，如玻璃酸钠滴眼液中的透明质酸钠可能加重已有损伤部位的疼痛。或对药物成分过敏引发接触性睑皮炎，表现为眼周皮肤瘙痒伴鳞屑。极少数情况下可能因操作不当导致瓶口划伤结膜，此时疼痛呈持续性且伴随流泪增多。出现上述情况应立即停用并冲洗眼睛，及时就诊排查原因。
建议滴眼药水前清洁双手，避免瓶口接触睫毛或眼球。使用两种以上眼药水需间隔10分钟，凝胶剂型应最后使用。佩戴隐形眼镜者需确认药物是否适用，多数眼药水使用前需摘除镜片。日常注意观察用药反应，保存药品说明书以备查阅。眼部持续不适或出现分泌物增多等情况时，应携带剩余药品至眼科就诊。
