全飞秒手术时眼睛轻微移动通常不会影响手术效果，但大幅移动可能导致激光定位偏差。手术设备配备实时追踪系统可自动调整，医生也会在术前进行固视训练降低风险。
全飞秒手术采用红外线追踪技术，当眼球出现微小移动时，设备会以高速率捕捉并同步调整激光发射位置。角膜瓣制作和透镜切削过程均在计算机控制下完成，正常生理性眼动在可控范围内不会干扰手术精度。术前使用的表面麻醉剂可减少角膜敏感度，开睑器能有效维持眼睑张开状态，患者配合医生注视固定光源时，眼球稳定性通常能达到手术要求。术中医生会通过显微镜实时监控眼球位置，若发现异常偏移可暂停操作重新定位。
当眼球出现超过设备追踪范围的剧烈移动时，可能造成激光切削中心偏移或角膜瓣不规则。这种情况多发生在患者突然咳嗽、打喷嚏或过度紧张时，可能导致术后散光、视力恢复延迟或视觉质量下降。部分特殊角膜形态如角膜过平、瞳孔过大者，眼球移动对手术的影响会相对更明显。术前充分沟通和模拟训练能帮助患者熟悉手术过程，术中采用负压吸引环固定眼球可提供额外稳定性保障。
术后需按医嘱使用左氧氟沙星滴眼液预防感染，配合氟米龙滴眼液控制炎症反应，使用玻璃酸钠滴眼液保持角膜湿润。避免揉眼、游泳等可能影响角膜愈合的行为，定期复查角膜地形图评估切削区对位情况。若术后出现持续视物模糊、重影等症状应及时返院检查，必要时可通过个性化激光补矫或佩戴硬性角膜接触镜进行光学矫正。
