硫磺熏制的中药可能影响药效并存在健康风险，常见于部分根茎类药材的加工过程。硫熏可能导致药材有效成分破坏、二氧化硫残留超标、刺激胃肠黏膜、诱发过敏反应、加重肝肾代谢负担等问题。
硫磺熏蒸过程产生的高温与化学反应可能分解药材中的活性成分，如黄芪中的黄芪甲苷、当归中的阿魏酸等。部分挥发性成分在熏制过程中流失，导致药材治疗作用减弱。临床使用这类药材时可能出现剂量不足或疗效不稳定的情况。
硫熏药材常残留过量二氧化硫，国际食品法典委员会规定中药材二氧化硫残留限量不得超过150mg/kg。长期摄入超标的二氧化硫可能损伤呼吸道黏膜，引发慢性咳嗽或哮喘。对哮喘患者及过敏体质者风险更高，可能诱发支气管痉挛。
二氧化硫遇水生成亚硫酸，直接刺激胃肠黏膜。服用硫熏药材后可能出现胃痛、反酸、腹泻等消化道症状，原有胃炎或肠易激综合征患者症状可能加重。部分患者会出现食欲减退、恶心等不良反应。
硫磺及其衍生物可作为半抗原引发变态反应，表现为皮肤瘙痒、红斑或荨麻疹。过敏体质者接触硫熏药材后可能发生接触性皮炎，严重时出现喉头水肿等全身过敏反应。临床报道显示硫熏菊花、山药等药材更易诱发过敏。
肝脏需代谢二氧化硫转化为硫酸盐经肾排出，长期服用硫熏药材可能增加肝肾解毒压力。慢性肝肾疾病患者代谢能力下降，更易出现毒素蓄积。动物实验表明高剂量二氧化硫可导致肝细胞空泡变性和肾小管损伤。
购买中药材时应选择正规渠道产品，注意观察药材色泽是否自然、有无刺鼻酸味。服用中药后出现异常症状应立即停用并就医，慢性病患者用药前建议咨询医师。日常存放药材应置于阴凉干燥处，避免受潮霉变而被迫使用硫熏法保存。
