扁桃体结石通常无须特殊治疗，但若伴随反复感染或明显不适，建议就医处理。扁桃体结石主要由食物残渣、细菌及脱落细胞堆积形成，多数情况下可通过日常护理缓解。
体积较小的扁桃体结石可能无明显症状，部分患者仅表现为轻微咽部异物感或口臭。日常可通过淡盐水漱口、保持口腔卫生、多饮水等方式促进结石自然脱落。扁桃体隐窝较深者易残留分泌物，可配合软毛牙刷轻柔清洁扁桃体表面，避免用力刮擦导致黏膜损伤。若结石位置较浅，部分患者咳嗽或进食时可能自行排出。
当结石引发持续咽痛、吞咽困难、扁桃体红肿或反复化脓性扁桃体炎时，需医疗干预。医生可能使用无菌器械取出结石，合并感染者需配合抗生素如阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克洛分散片或克林霉素胶囊治疗。长期反复发作的顽固性结石合并慢性扁桃体炎者，可考虑扁桃体切除术。儿童患者若因结石影响进食或睡眠，家长需及时带其就诊评估。
保持每日两次巴氏刷牙法清洁口腔，饭后使用含氯己定的漱口水减少细菌滋生。避免高糖饮食及奶制品残留，吸烟者应戒烟以降低隐窝分泌物黏稠度。若发现扁桃体表面白色颗粒物持续存在超过两周，或伴随发热、颈部淋巴结肿大，建议至耳鼻喉科进行喉镜及细菌培养检查。日常可适当增加维生素C摄入增强黏膜修复能力，但无需刻意补充益生菌或使用民间偏方强行掏取结石。
