滤泡性结膜炎通常可以不用药自愈，但若症状持续或加重则需药物治疗。滤泡性结膜炎多为病毒感染或过敏反应引起，表现为眼睑结膜滤泡增生、眼红、异物感等症状。
多数滤泡性结膜炎患者症状较轻，病程具有自限性。病毒感染引起的滤泡性结膜炎通常在7-10天内自行消退，过敏因素导致的症状在脱离过敏原后也可缓解。此阶段可通过冷敷缓解眼部充血，使用人工泪液冲洗结膜囊减少刺激，避免揉眼或佩戴隐形眼镜。保持眼部清洁、减少电子屏幕使用时间有助于症状改善。
若出现眼部脓性分泌物增多、视力下降、剧烈疼痛或症状超过两周未缓解，可能合并细菌感染或存在其他眼部疾病。此时需就医明确病因，医生可能开具抗病毒滴眼液如更昔洛韦滴眼液，过敏性结膜炎可使用奥洛他定滴眼液，细菌性感染需用左氧氟沙星滴眼液。严重病例可能需短期使用低浓度糖皮质激素滴眼液如氟米龙滴眼液控制炎症。
滤泡性结膜炎患者应避免与他人共用毛巾等个人物品，防止交叉感染。饮食上可增加富含维生素A的食物如胡萝卜、菠菜，有助于结膜修复。若为过敏体质，需注意环境清洁，定期更换床单减少尘螨接触。症状轻微时密切观察即可，但出现畏光流泪、结膜出血等表现应及时就诊，避免自行使用眼药水导致病情延误。
