会厌囊肿是否需要手术取决于囊肿大小和症状严重程度，多数情况下体积较小且无症状的囊肿无须手术，体积较大或影响吞咽呼吸的囊肿通常建议手术切除。
体积较小的会厌囊肿通常无明显症状，可能因咽喉部检查偶然发现。这类囊肿生长缓慢，极少恶变，可通过定期喉镜复查监测变化。日常需避免辛辣刺激饮食，减少咽喉黏膜刺激。若囊肿直径超过10毫米或引起咽喉异物感、吞咽不畅等症状，可能干扰正常生理功能。喉镜下可见囊肿表面光滑、囊壁薄，可能压迫会厌软骨导致发音改变。
存在明显临床症状的会厌囊肿需考虑手术干预。当囊肿导致反复感染、呼吸不畅或进食困难时，喉显微外科手术是首选方案。常见术式包括支撑喉镜下CO2激光切除术或低温等离子消融术，术后需禁声休息并预防性使用抗生素。极少数情况下巨大囊肿可能阻塞气道引发窒息，需紧急气管切开联合囊肿切除。
术后应保持口腔清洁，使用生理盐水漱口，两周内进食温凉流质食物。避免剧烈咳嗽和用力清嗓，定期复查喉镜观察创面愈合情况。戒烟酒及过热饮食，减少咽喉部刺激可降低复发概率。若出现术后出血、持续疼痛或发热需及时返院检查。
