基孔肯雅热主要由埃及伊蚊和白纹伊蚊传播。这两种蚊子通过叮咬感染者后携带病毒，再叮咬健康人时将病毒传播给新的宿主。
埃及伊蚊是热带和亚热带地区常见的蚊种，喜欢在室内或靠近人类居住区的积水中繁殖，如花盆、水桶、废弃轮胎等小型容器。其活动高峰在清晨和傍晚，叮咬时攻击性强且不易被察觉。白纹伊蚊又称亚洲虎蚊，适应力更强，可在较凉爽地区生存，体表有显著白色条纹，同样通过小型积水繁殖，全天均有叮咬行为但以白天为主。这两种蚊子在叮咬病毒血症期患者后，病毒在其唾液腺增殖，经过一定潜伏期即具备传播能力。
预防基孔肯雅热的关键是防蚊灭蚊。清除居住环境周围的积水容器，安装纱窗纱门，使用含有避蚊胺的驱蚊剂，外出时穿浅色长袖衣裤。出现突发高热、关节剧痛、皮疹等症状且近期有蚊虫叮咬史时，应及时就医进行病毒检测。目前尚无特效抗病毒药物，治疗以缓解症状为主，多数患者2-3周可康复，但部分人可能遗留数月关节疼痛。
