病毒性和细菌性发烧可通过病原体类型、症状特点、实验室检查等方面进行区别。病毒性感染通常表现为自限性病程、淋巴细胞比例升高，细菌性感染则常见中性粒细胞增多、局部化脓性表现等。
病毒性发烧由流感病毒、鼻病毒等引起，细菌性发烧则多与链球菌、葡萄球菌等感染有关。病毒通过入侵宿主细胞复制增殖，细菌则依赖自身代谢产生毒素或直接破坏组织。
病毒性发热多为中低热且波动较大，细菌性发热常呈稽留高热。病毒性感染发热持续时间较短，细菌感染未治疗时发热可持续加重。
病毒性感染多伴全身酸痛、流涕等弥漫症状，细菌感染常见局部红肿热痛。病毒性咽炎咽部充血弥散，细菌性扁桃体炎可见脓性渗出物。
病毒感染者白细胞总数正常或降低，淋巴细胞比例升高。细菌感染表现为白细胞总数增高，中性粒细胞比例上升并可能出现核左移。
病毒性感染以对症支持为主，细菌性感染需针对性使用抗生素。病毒性感冒可用布洛芬缓解症状，细菌性肺炎需根据药敏选用阿莫西林等药物治疗。
观察发热规律与伴随症状有助于初步判断感染类型，但最终需结合血常规、C反应蛋白等实验室检查。病毒性感染应注意休息补水，细菌性感染须遵医嘱足疗程用药。持续高热不退或出现意识改变等严重症状时，应及时就医明确诊断。日常需加强手卫生与呼吸道防护，减少病原体接触机会。
