小肠主要吸收碳水化合物、蛋白质、脂肪、维生素、矿物质和水等营养物质。
小肠通过刷状缘上的消化酶将多糖分解为单糖，如葡萄糖、果糖和半乳糖，随后通过主动运输或易化扩散吸收进入血液。淀粉类食物需经唾液淀粉酶和胰淀粉酶初步分解，最终在小肠黏膜完成吸收。
蛋白质被胃蛋白酶和胰蛋白酶分解为氨基酸或短肽，通过氨基酸转运蛋白或肽转运蛋白吸收。部分未完全消化的蛋白质可能引发过敏反应，健康人群通常可高效吸收动物蛋白和植物蛋白中的必需氨基酸。
脂肪经胆汁乳化形成微滴，被胰脂肪酶分解为甘油一酯和游离脂肪酸，与胆盐结合形成微胶粒后进入肠上皮细胞，重新酯化为甘油三酯并形成乳糜微粒进入淋巴系统。脂溶性维生素依赖该途径同步吸收。
水溶性维生素如B族维生素和维生素C通过被动扩散吸收，维生素B12需与内因子结合后在回肠特异性吸收。脂溶性维生素A、D、E、K需依赖脂肪吸收机制，吸收障碍可能导致夜盲症或凝血异常。
钠、钾、钙等矿物质通过主动运输或离子通道吸收，铁和锌在十二指肠特异性吸收。水分伴随电解质通过渗透作用被动吸收，每日约有6-8升消化液在小肠重吸收维持水电解质平衡。
均衡摄入全谷物、瘦肉、深海鱼、乳制品及新鲜蔬菜水果有助于维持小肠吸收功能。避免长期高脂高糖饮食可减少肠黏膜损伤，出现慢性腹泻或营养不良症状时应及时排查乳糜泻或短肠综合征等吸收障碍疾病。
