支气管镜检查可能出现的并发症包括喉痉挛、出血、气胸、感染等，多数为轻微且可控。
检查过程中器械刺激可能引发喉部肌肉痉挛，表现为呼吸困难或窒息感，需立即停止操作并给予吸氧，必要时使用支气管扩张剂如沙丁胺醇缓解症状。
黏膜活检或刷检可能导致局部出血，少量渗血可自行停止，大量出血需用肾上腺素棉球压迫或电凝止血，严重者需输血治疗。
肺组织损伤可能导致气体进入胸膜腔，出现胸痛和呼吸困难，轻度气胸可观察吸氧，严重者需胸腔闭式引流。
器械消毒不彻底或患者免疫力低下可能引发肺部感染，表现为发热和咳嗽加重，需根据病原学结果选用抗生素如阿莫西林、左氧氟沙星等治疗。
检查后2小时内禁食禁水，24小时内避免剧烈运动，出现持续胸痛或咯血需立即就医。
