先天性结膜炎通常可以治愈，具体治疗效果与病因、病情严重程度及治疗时机有关。先天性结膜炎主要由遗传因素、产道感染或新生儿泪道发育异常引起，需通过药物或手术干预。
细菌性先天性结膜炎可遵医嘱使用妥布霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等抗生素控制感染。病毒性结膜炎需使用更昔洛韦眼用凝胶等抗病毒药物。过敏性结膜炎可配合色甘酸钠滴眼液缓解症状。用药期间需定期复查，避免自行调整剂量。
对于泪道阻塞导致的结膜炎，可在3-6月龄进行泪道探通术。该操作通过机械疏通鼻泪管改善泪液引流，术后需配合抗生素滴眼液预防感染。多数患儿一次手术即可治愈，少数需重复进行。
严重分泌物积聚时需生理盐水冲洗结膜囊，清除脓性分泌物。操作需由医护人员完成，避免损伤角膜。冲洗后可联合抗生素眼膏包眼，增强药物接触时间。
保持居室通风减少尘螨，避免接触宠物毛发等过敏原。哺乳期母亲需注意乳头清洁，防止细菌传播。患儿衣物应单独洗涤并阳光暴晒，降低交叉感染概率。
若与遗传性眼病相关，建议进行基因检测明确病因。家族中有类似病史者，孕期需加强产前检查。部分代谢异常相关结膜炎需长期随访，监测视力发育情况。
先天性结膜炎患儿日常需使用专用毛巾，避免揉眼。母乳喂养有助于增强免疫力，辅食添加后多补充维生素A。定期眼科复查直至症状完全消失，若出现眼睑肿胀加剧或角膜混浊需立即就诊。多数患儿经规范治疗预后良好，但合并全身疾病者可能需多学科联合管理。
