白芸豆阻断片可能引起胃肠不适、过敏反应、血糖波动等副作用，通常与个人体质或过量服用有关。
白芸豆阻断片中的α-淀粉酶抑制剂可能干扰淀粉消化，部分人群服用后会出现腹胀、腹泻或腹部绞痛。胃肠功能较弱者更易发生此类反应，建议从小剂量开始尝试，避免空腹服用。若症状持续，需暂停使用并咨询医生。
对豆类过敏者可能出现皮肤瘙痒、皮疹或呼吸道不适等过敏症状。白芸豆蛋白可能作为过敏原引发免疫反应，严重时可导致血管性水肿。使用前应确认过敏史，初次服用后观察数小时，出现过敏征兆须立即停药就医。
虽然白芸豆阻断片通过抑制淀粉吸收帮助控糖，但糖尿病患者联合降糖药物使用时，可能引发低血糖风险。表现为头晕、冷汗等症状。建议用药期间密切监测血糖，调整降糖方案需在医生指导下进行。
长期大量服用可能影响碳水化合物及部分脂溶性维生素的吸收，导致营养失衡。表现为乏力或微量元素缺乏症状。健康人群间断使用较为安全，慢性病患者需评估营养状态后再决定是否使用。
与阿卡波糖等降糖药联用可能增强降糖效果，增加低血糖概率。部分消化酶制剂也可能被其抑制活性。服用慢性病药物者应告知医生白芸豆阻断片使用情况，避免药物协同或拮抗作用。
使用白芸豆阻断片期间建议保持饮食均衡，避免高淀粉饮食以减轻消化负担。出现持续不适需及时停用，特殊体质或慢性病患者应在营养师指导下控制服用周期。日常可搭配适量运动促进代谢，但避免与剧烈运动同时进行以防低血糖发生。
