紧急避孕药内含有的雌激素水平很高，服用一次紧急避孕药的药量基本上相当于服用了8天的常规短效口服避孕药的药量，紧急避孕药由于其抑制，延迟排卵的作用和抑制子宫内膜的作用，可使下次月经延期，也可能由于临时用药造成的一次性血液中激素水平的暂时升高，下降后发生撤退性出血，表现为月经提前。紧急避孕药的副作用就是会导致以下问题:内分泌紊乱，月经不调，闭经，不孕，或者肠胃不适，头痛，体重增加，神经紧张，情绪低潮，皮肤色斑和粉刺等症状。服用量过大，会产生肠胃不适、月经周期紊乱、卵巢抑制等现象，破坏了正常的月经，造成内分泌紊乱。如果长时间服用紧急避孕药，严重者还会造成闭经的现象，甚至是会造成不孕的严重后果。紧急避孕药并非常规的避孕措施，而只是一种紧急的补救措施，只有在正常的避孕方法上没有达到效果时，再进行补救使用，或者在避孕套出现破损，精液流入子宫时采用的紧急避孕，而不应当被作为是一种常规的避孕药物来进行使用。
