甲状腺活检穿刺通常会有轻微疼痛感，但多数人可以耐受。疼痛程度主要与个人痛阈、穿刺部位敏感度、操作手法等因素有关。
甲状腺活检穿刺使用细针进行，操作前会进行局部麻醉，穿刺时可能感受到类似抽血或打针的短暂刺痛。部分人仅觉局部压迫感，少数敏感人群可能出现持续隐痛。医生会在操作中通过调整进针角度、控制抽吸速度等方式减轻不适。术后轻微胀痛多在1-2小时内消退，冰敷可帮助缓解。
极少数情况下可能出现明显疼痛，多见于甲状腺位置异常、结节质地坚硬或合并甲状腺炎的患者。若穿刺时刺激到包膜神经或反复穿刺，可能产生放射痛至耳部或下颌。对疼痛极度敏感者，可提前与医生沟通使用镇痛措施。
术后保持穿刺部位清洁干燥，避免颈部剧烈活动。出现持续剧痛、肿胀加剧或发热需及时就医。检查前避免空腹，放松心情有助于减轻应激反应。甲状腺活检是诊断结节性质的重要方法，短暂不适相比其临床价值是可接受的。
