灰指甲传染潜伏期在每一个人的身上时间都是不同的，最短的1~2个月，最长的可以达到3~6年左右。如果身体有真菌感染应该积极的进行抗真菌治疗，并且按疗程用药，定期进行复查。如果感染甲床、甲板造成的灰指甲，临床上局部用药时应该用磨刀或指甲磋，磋磨异常指甲使指甲变薄，再涂抹抗真菌外用药物。也可以选择尿素软膏封包病甲，让其脱落之后再外用药物治疗。针对病程较长单纯性外用药物效果不好的患者，可以选择口服伊曲康唑胶囊抗真菌的药物，或者特比萘芬片进行治疗，但是用药期间要定期检查肝脏功能，所有的用药应该在专科医生的指导下使用。
