下丘脑性闭经，是指中枢神经系统以及下丘脑各种功能和气质性疾变疾病所引起的闭经。以功能性原因为主。这一类，毕竟的特点是下丘脑合成和分泌gnihh缺陷或者是下降导致垂体的促性腺激素以及卵泡刺激素和黄体生成素分泌功能的下降。因此，属于低促性腺激素性闭经。如果治疗及时是可以逆转的。造成功能性下丘脑性闭经的原因，是精神应激突然或者是长期的精神压抑、紧张、忧虑、环境的改变、过度劳累、情感变化、寒冷等等都可能会引起神经内分泌障碍而导致闭经。另外，体重下降，神经性厌食症，由于中枢神经对体重急剧下降及其敏感，也会引起继发性闭经。另外，长期的运动、剧烈运动导致运动性闭经以及一些药物引起的药物性闭经都属于下丘脑性闭经。
