茴香醚具有一定的抑菌作用，但杀菌效果有限，其抗菌活性主要针对部分细菌和真菌，无法替代专业消毒剂或抗生素。
茴香醚中的苯丙素类成分可通过破坏微生物细胞膜结构产生抑菌效果，对金黄色葡萄球菌等革兰氏阳性菌有一定抑制作用。
对白色念珠菌等部分真菌及大肠杆菌等特定菌株有抑制效果，但对病毒、芽孢及多数耐药菌无效。
需较高浓度才显现抑菌活性，日常使用中难以达到有效杀菌浓度，且作用时间较短。
可作为食品天然防腐剂辅助使用，在医疗消毒领域仍需选择过氧化氢、含氯消毒剂等专业杀菌产品。
使用茴香醚相关制品时需避免接触眼睛及破损皮肤，出现过敏反应应立即停用并就医。
