没有打农药的水果通常也需要清洗。水果表面可能附着灰尘、虫卵、细菌或天然农药残留，清洗有助于降低健康风险。
水果在自然生长过程中可能接触土壤、昆虫或鸟类排泄物，表面容易沾染灰尘和微生物。即使未使用人工农药，部分植物会分泌天然防御性物质，如苹果表面的果蜡。流动清水冲洗可去除大部分污染物，粗糙表皮的水果可用软毛刷轻刷。草莓等娇嫩水果建议在食用前浸泡3-5分钟，避免提前清洗导致腐败。
部分野生或有机种植的水果可能携带更多虫卵或微生物，需重点清洗凹陷处。热带水果如芒果表皮可能含有漆酚类物质，清洗后削皮食用更安全。直接采摘的水果可能沾染动物粪便中的致病菌，需彻底清洁。某些水果表面天然存在的酵母菌也可能引起胃肠不适。
建议使用流动清水配合食品级清洁剂轻柔搓洗，避免使用洗涤剂或高温水。清洗后可用厨房纸吸干水分，带皮水果建议去皮食用。特殊人群如孕妇、儿童或免疫力低下者，更需注意彻底清洁。若发现水果霉变或异味，应立即丢弃不可食用。
