水果榨汁饮用有一定好处，但整体营养价值低于直接食用新鲜水果。水果榨汁后主要保留水分和部分水溶性维生素，但膳食纤维损失较多，且容易导致糖分摄入过量。
水果榨汁过程中，细胞壁被破坏，原本包裹在细胞内的糖分会快速释放，导致血糖上升速度加快。对于需要控制血糖的人群，直接吃完整水果更有利于血糖稳定。榨汁还会破坏水果中的部分抗氧化物质，如维生素C在接触氧气和高温时容易氧化流失。柑橘类水果榨汁后维生素C损失可达一半以上，苹果汁的多酚类物质在榨取后几小时内就会明显减少。榨汁后残渣被丢弃，导致水果中不溶性膳食纤维几乎全部损失，这些纤维对促进肠道蠕动、维持肠道菌群平衡有重要作用。
特殊情况下榨汁饮用具有一定优势。对于胃肠功能较弱、咀嚼困难的老年人或术后恢复期患者，适量饮用新鲜榨取的果汁可以帮助补充水分和部分营养素。牙齿发育期的婴幼儿也可通过稀释果汁获取部分维生素，但需控制每日摄入量不超过120毫升。选择连渣一起食用的破壁料理机制作果浆，能保留更多膳食纤维。部分水果如石榴、蓝莓等经过适度破碎后，某些抗氧化成分的生物利用率反而会提高。
日常饮用果汁需注意选择新鲜成熟水果现榨现喝，避免添加糖分。每日果汁摄入量建议控制在200毫升以内，儿童应减半。糖尿病患者、高尿酸血症患者及减肥人群更应限制果汁摄入，优先选择低糖水果直接食用。完整水果的咀嚼过程能产生更强饱腹感，有利于控制总热量摄入。保存水果营养的最佳方式仍是清洗后直接食用，可搭配坚果或酸奶平衡营养。
