自身免疫性脑炎多数情况下可以治愈，治疗方式主要有免疫治疗、对症治疗、康复治疗、病因治疗等。
免疫治疗是自身免疫性脑炎的主要治疗手段，常用药物包括甲泼尼龙、丙种球蛋白、利妥昔单抗等，有助于抑制异常免疫反应。
针对癫痫发作可使用左乙拉西坦、丙戊酸钠等抗癫痫药物，精神症状可选用奥氮平、喹硫平等精神类药物。
认知功能障碍患者需要进行认知康复训练，肢体功能障碍者需进行物理治疗，言语障碍者需进行言语训练。
部分患者需针对肿瘤等病因进行治疗，如合并肿瘤需手术切除，合并感染需抗感染治疗。
患者应保持规律作息，避免劳累，定期复查脑电图、脑脊液等指标，在医生指导下调整治疗方案。
