做肠镜的过程通常不会产生明显疼痛，但可能伴随轻微不适或腹胀感。肠镜检查的疼痛感受因人而异，主要与个体耐受性、肠道准备情况、医生手法熟练度等因素相关。
多数人在肠镜检查中仅会感到腹部胀满或轻微牵拉感。检查前使用的镇静药物可帮助放松肠道平滑肌，减轻不适。肠镜通过肠道弯曲部位时可能出现短暂胀痛，但持续时间较短。医生会通过注气扩张肠腔便于观察，过程中可随时沟通调整操作力度。肠道准备充分者因肠腔清洁度高，器械移动阻力小，不适感更轻微。
少数对疼痛敏感或存在肠粘连的患者可能出现较强痛感。既往腹部手术史导致肠道解剖结构异常者，肠镜通过瘢痕区域时可能引发疼痛。炎症性肠病活动期患者因肠壁水肿脆弱，检查时痛感可能加重。这类情况可选择无痛肠镜，在静脉麻醉下完成检查。过度紧张焦虑可能放大不适感，检查前与医生充分沟通有助于缓解焦虑。
检查后1-2天内应避免剧烈运动，饮食从流质逐步过渡到低渣饮食。出现持续腹痛、便血或发热需及时就医。定期肠镜检查是结直肠癌筛查的重要手段，建议50岁以上人群每5-10年进行一次检查。
