消除海鲜中的细菌可通过高温烹饪、低温冷冻、盐水浸泡、醋或柠檬汁处理、使用专用清洁剂等方法。海鲜可能携带副溶血性弧菌、沙门氏菌等致病菌，需针对性处理以保障食用安全。
彻底加热是杀灭海鲜中细菌最有效的方式。建议将海鲜中心温度加热至75摄氏度以上并持续1分钟，可灭活绝大多数病原体。蒸煮、油炸或烤制时需确保食材完全熟透，避免生食或半生食。贝类应煮沸至外壳张开后继续加热数分钟，甲壳类需变红且肉质不透明。
-18摄氏度以下冷冻7天可灭活部分寄生虫及细菌。商业级超低温冷冻效果更佳，家庭冰箱冷冻需延长至两周。冷冻虽不能完全杀灭所有微生物，但能显著抑制细菌繁殖。解冻后仍需充分加热，冷冻处理后的刺身级海鲜仍存在风险。
用3％-5％浓度的盐水浸泡海鲜30分钟，可减少表面细菌数量。此方法对弧菌类效果较好，但无法渗透至食材内部。需配合后续烹饪使用，浸泡后要用清水冲洗。活体海鲜吐沙时可同步杀菌，但浓度过高会影响肉质。
食醋或柠檬汁浸泡15分钟能改变细菌生存环境，对部分微生物有抑制作用。pH值低于4.5时可使部分病原体失活，但无法替代加热。常用于生腌海鲜的预处理，处理后仍需冷藏保存。酸性环境对寄生虫卵灭活效果有限。
食品级过氧乙酸或次氯酸钠溶液可用于海鲜加工前的表面消毒。需按说明书稀释使用，处理后彻底冲洗。此方法多用于商业处理，家庭使用需注意药剂残留。臭氧水处理也是新兴的有效杀菌方式。
处理海鲜时需佩戴手套避免交叉感染，刀具砧板要生熟分开。购买后2小时内冷藏，冷冻海鲜避免反复解冻。儿童、孕妇及免疫力低下者应避免生食，出现腹泻呕吐等症状需及时就医。建议通过正规渠道购买检疫合格的海产品，夏季高温季节需特别注意存储条件。
