生吃大蒜可能刺激胃肠黏膜，胃肠功能较弱者、胃溃疡患者、胃炎患者、肠易激综合征患者及手术前后人群不宜生吃。
大蒜中的大蒜素具有强烈刺激性，可能引发胃肠功能较弱者出现腹痛、腹泻等不适。这类人群消化液分泌较少，黏膜修复能力较差，生食大蒜可能加重消化不良症状。建议将大蒜煮熟后食用，或选择发酵黑蒜等温和形式。
胃溃疡患者的胃黏膜存在破损病灶，生大蒜可能刺激溃疡面导致疼痛加剧，甚至引发出血。胃溃疡通常与幽门螺杆菌感染、胃酸分泌异常有关，表现为上腹隐痛、反酸等症状。治疗可选用奥美拉唑肠溶胶囊、胶体果胶铋胶囊等药物，同时需避免辛辣刺激饮食。
急慢性胃炎患者胃黏膜处于炎症状态，生大蒜可能加重黏膜充血水肿。胃炎多由感染、药物刺激或胆汁反流引起，常见症状包括胃胀、恶心等。急性期应选用硫糖铝混悬凝胶、铝碳酸镁咀嚼片等黏膜保护剂，恢复期可少量食用熟制大蒜。
这类人群肠道敏感性增高，大蒜素可能诱发腹痛、腹胀等肠道不适反应。肠易激综合征属于功能性肠病，与内脏高敏感性、肠道菌群紊乱相关，表现为排便习惯改变。治疗可选用匹维溴铵片、双歧杆菌三联活菌胶囊等调节肠道功能。
围手术期患者需避免生大蒜影响凝血功能或刺激手术创面。大蒜素可能增强抗凝药物效果，增加出血风险。术前2周应停止生食大蒜，术后恢复期也须暂时避免，待胃肠功能完全恢复后可逐步尝试熟蒜制品。
特殊人群食用大蒜需注意烹调方式，胃肠疾病患者应优先选择蒸煮等温和烹饪方法。日常可观察食用后的排便情况，出现明显不适需及时调整饮食。服用抗凝药物者、过敏体质者及眼疾患者也需谨慎控制生蒜摄入量，必要时咨询医师或营养师制定个性化饮食方案。
