消化功能不全、肾功能不全、痛风或高尿酸血症、甲状腺功能减退、大豆过敏等患者不宜吃大豆。大豆含有丰富的植物蛋白、嘌呤和抗营养物质，可能加重原有疾病或引发不良反应。
大豆中的低聚糖和膳食纤维可能刺激胃肠蠕动，加重腹胀、腹泻等症状。胃肠手术后或慢性肠炎患者消化酶分泌不足，难以分解大豆蛋白，可能诱发腹痛。建议此类患者选择易消化的动物蛋白替代，必要时可咨询医生使用胰酶肠溶胶囊辅助消化。
大豆蛋白代谢会增加含氮废物，加重肾脏排泄压力。肾功能衰竭患者血肌酐水平升高时，摄入大豆可能加速肾功能恶化。此类患者需限制植物蛋白摄入，优先选用低磷低钾的麦淀粉作为主食，并遵医嘱服用尿毒清颗粒控制病情。
大豆嘌呤含量较高，每100克干豆含嘌呤约150毫克，代谢后生成尿酸可能诱发关节肿痛。急性发作期患者应严格禁食，缓解期每日嘌呤摄入需控制在300毫克以内。可遵医嘱使用非布司他片抑制尿酸生成，配合碳酸氢钠片碱化尿液。
大豆异黄酮可能干扰甲状腺过氧化物酶活性，影响左甲状腺素钠片的吸收效率。患者食用大豆制品需与服药间隔4小时以上，定期监测促甲状腺激素水平。若出现怕冷、水肿等症状加重，应及时调整优甲乐剂量并减少豆制品摄入。
大豆蛋白可能引发荨麻疹、喉头水肿等IgE介导的过敏反应。婴幼儿首次添加需观察72小时，出现皮疹需立即停用并口服氯雷他定糖浆。严重者应随身携带肾上腺素笔，避免接触含大豆蛋白的加工食品。
特殊人群食用大豆前建议咨询营养师，肾功能不全者需监测尿蛋白定量，痛风患者注意每日饮水量保持在2000毫升以上。大豆制品宜选择发酵类如纳豆、味噌，其抗营养物质含量较低。对必须限制大豆摄入的患者，可通过鸡蛋、鱼肉等补充优质蛋白，同时定期复查相关指标。
