大蒜对多种细菌具有抑制作用，主要包括金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、白色念珠菌、幽门螺杆菌等。大蒜中的大蒜素等活性成分能干扰细菌代谢，破坏细胞膜结构，从而抑制其生长繁殖。
大蒜对金黄色葡萄球菌的抑制作用较强。金黄色葡萄球菌是常见的致病菌，可能引起皮肤感染、食物中毒等。大蒜中的硫化物能破坏其细胞壁合成，临床研究显示大蒜提取物可降低该菌的耐药性。日常适当食用大蒜有助于预防此类感染，但严重感染仍需及时就医。
大蒜对部分致病性大肠杆菌株系有抑制效果。这类细菌可能导致腹泻、尿路感染等疾病。大蒜素能阻断细菌DNA复制，减少其黏附能力。对于胃肠功能较弱者，适量食用大蒜或有助于调节肠道菌群，但不可替代药物治疗。
大蒜提取物对肺炎克雷伯菌显示抗菌活性。该菌是医院获得性肺炎的常见病原体，大蒜中的阿霍烯成分可破坏其生物膜形成。对于呼吸道易感人群，饮食中加入大蒜可能辅助预防，但出现发热、咳痰等症状需立即就医。
大蒜对白色念珠菌等真菌有抑制作用。白色念珠菌过度增殖可能引发口腔或阴道念珠菌病，大蒜中的硫代亚磺酸酯能干扰真菌细胞膜稳定性。日常可适当食用大蒜，但真菌感染需遵医嘱使用抗真菌药物如氟康唑胶囊。
大蒜可能辅助抑制幽门螺杆菌生长。该菌与胃炎、胃溃疡密切相关，大蒜素能降低其尿素酶活性。胃病患者可适量食用新鲜大蒜，但根治幽门螺杆菌感染需规范使用阿莫西林胶囊、克拉霉素片等联合疗法。
建议将大蒜摄入量控制在每日1-3瓣生蒜或等效烹饪用量，过量可能刺激胃肠黏膜。特殊人群如胃溃疡急性期、术前患者应避免生食。大蒜不能替代抗生素治疗，细菌感染症状持续或加重时，应及时进行病原学检测并接受规范抗感染治疗。日常可搭配富含益生菌的食物如酸奶，维持菌群平衡。
