大蒜不能直接治疗腹部疼痛，但可能对某些胃肠不适有辅助缓解作用。腹部疼痛可能由胃肠功能紊乱、胃炎、肠易激综合征、消化性溃疡、胆道疾病等多种原因引起，建议明确病因后针对性治疗。
大蒜含有大蒜素等活性成分，具有抗菌、抗炎和促进胃肠蠕动的特性，可能对因轻微胃肠功能紊乱或细菌感染引起的腹胀、隐痛产生一定效果。将1-2瓣生蒜捣碎后温水送服，或与食物同食，可能帮助缓解功能性消化不良伴随的腹部不适。大蒜中的硫化物还能刺激胃黏膜分泌消化液，改善因胃酸不足导致的饭后饱胀感。
但大蒜对器质性疾病引起的腹痛无效且可能加重症状。胃溃疡患者食用可能刺激溃疡面导致疼痛加剧，肠梗阻患者可能因大蒜促进肠蠕动而诱发肠绞痛，胆囊炎患者摄入大蒜可能刺激胆道收缩引发胆绞痛。生蒜的强刺激性还可能直接损伤胃肠黏膜，导致反酸、烧心等新发症状。
出现持续腹痛超过6小时、疼痛剧烈伴呕吐发热、便血或腹部板状硬等情况须立即就医。日常可记录疼痛与饮食的关系，避免空腹食用大蒜，胃炎患者建议选择熟蒜减少刺激。确诊病因前不建议依赖大蒜止痛，尤其儿童、孕妇及服用抗凝药物者需谨慎。
