大蒜具有一定的抑菌作用，但无法达到专业消毒效果。大蒜中的大蒜素等活性成分对部分细菌、真菌有抑制作用，但作用范围有限且浓度不足。
大蒜的抑菌作用主要来源于其含有的有机硫化合物，如大蒜素、阿霍烯等。这些成分能破坏微生物细胞膜结构，干扰其代谢过程，对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等常见致病菌有抑制作用。民间常用捣碎的大蒜汁处理轻微皮肤伤口或口腔炎症，短期内可能减少表面细菌数量。新鲜大蒜提取物在实验室条件下对部分呼吸道病毒也有一定抑制效果。
大蒜的抑菌效果受多种因素限制。其活性成分易受高温破坏，烹饪后抑菌能力显著下降。作用浓度远低于医用消毒剂标准，无法杀灭结核杆菌、肝炎病毒等顽固病原体。对细菌芽孢、寄生虫卵完全无效。家庭环境中若用大蒜处理刀具、餐具等物品，反而可能因有机物残留滋生细菌。
日常小伤口消毒可选用碘伏溶液，环境消毒建议使用含氯消毒剂。大蒜更适合作为饮食中的调味品和保健食品，每日食用1-2瓣新鲜大蒜有助于维持口腔和肠道菌群平衡。出现明确感染症状或需要器械消毒时，应及时采用专业医疗消毒措施。
