免疫组织化学病理诊断可能存在误差，但误差概率较低。误差通常与样本质量、抗体特异性、操作规范等因素相关。
免疫组织化学病理诊断的准确性高度依赖技术操作流程的标准化。样本固定不充分可能导致抗原丢失，脱水不彻底可能影响切片质量，抗体稀释比例不当可能引发交叉反应。自动化染色设备的校准误差、人工判读的主观差异、组织处理过程中的温度波动均可能成为误差来源。实验室需定期进行室内质控和室间比对，采用阳性对照和阴性对照排除假阴性与假阳性结果。
特殊情况下可能出现诊断偏差。低分化肿瘤因抗原表达缺失可能导致假阴性，某些抗体在多种肿瘤中非特异性表达可能造成假阳性。感染或坏死组织可能干扰抗原抗体结合，治疗后的标本可能出现抗原表达改变。罕见肿瘤因缺乏标准判读依据时，需结合分子检测或电镜检查辅助诊断。
免疫组织化学病理诊断仍是肿瘤诊断的重要工具，临床医师应结合形态学特征和其他检测结果综合判断。患者如对诊断结果存在疑问，可通过病理会诊或分子检测进一步验证。规范化的实验室操作和多重检测手段能显著降低误诊风险。
