阴茎囊肿不一定必须手术，多数情况下可通过保守治疗缓解。阴茎囊肿的处理方式主要有局部热敷、抗生素治疗、穿刺引流、手术切除、定期观察等。
早期较小的阴茎囊肿若无感染迹象，可采用局部热敷促进血液循环。每日用40℃左右温水毛巾外敷患处10-15分钟，有助于囊肿自行吸收。热敷期间需保持会阴清洁干燥，避免挤压囊肿。
合并细菌感染时可遵医嘱使用抗生素。常见如头孢克洛干混悬剂针对革兰阳性菌，左氧氟沙星片对混合感染有效，阿奇霉素分散片适用于支原体感染。用药期间需观察红肿热痛是否减轻，禁止自行调整剂量。
对于张力较大的囊肿，医生可能在无菌操作下进行穿刺抽液。术后需加压包扎并口服抗生素预防感染。该方法适合囊壁较薄、内容物稀薄的表皮样囊肿，复发概率较高。
反复发作或直径超过2厘米的囊肿建议手术。常用术式包括囊肿完整摘除术和包皮环切联合囊肿切除术。术后需定期换药，使用头孢呋辛酯片等预防性抗生素，两周内避免剧烈运动。
无症状的微小囊肿可暂不处理，每3-6个月复查超声监测变化。观察期间出现体积增大、破溃渗液、影响排尿等功能时需及时就医。先天性囊肿若未影响发育可延迟至青春期后处理。
日常应选择宽松透气的棉质内裤，避免会阴部长时间潮湿。清洗时使用温和沐浴露，忌用刺激性洗剂。饮食注意补充优质蛋白和维生素A，限制辛辣食物摄入。若囊肿出现颜色发黑、异常出血或短期内迅速增大，须立即就诊排除肿瘤性病变。术后恢复期应禁止性生活1-2个月，定期随访检查愈合情况。
