反复发烧后咳嗽伴随肚子两侧疼痛可能由普通感冒、支气管炎、肺炎、泌尿系统感染等原因引起，需结合具体症状判断病因。
病毒感染导致上呼吸道炎症，可能引起低热、咳嗽及腹部肌肉酸痛。保持休息与充足水分摄入，可遵医嘱使用对乙酰氨基酚、布洛芬或连花清瘟胶囊缓解症状。
炎症向下蔓延至支气管时，咳嗽加重并可能因频繁咳嗽牵拉腹部肌肉导致疼痛。可能与细菌感染或空气污染有关，表现为黄痰、气促，需遵医嘱使用阿莫西林、左氧氟沙星或氨溴索。
肺部感染可能引发持续高热、剧烈咳嗽及放射至腹部的牵涉痛，多与肺炎链球菌感染有关。需胸部影像学确诊，可遵医嘱使用头孢曲松、阿奇霉素或莫西沙星。
肾盂肾炎等泌尿系统感染可能表现为发热、腰痛放射至腹部两侧，伴随尿频尿急。可能与大肠杆菌感染有关，需尿检确诊，可遵医嘱使用呋喃妥因、磷霉素或头孢克肟。
若症状持续超过3天或出现高热不退、血尿等情况，建议及时就医完善血常规、尿常规及影像学检查，治疗期间避免辛辣刺激饮食，注意腹部保暖。
