松花蛋和鸭蛋在营养成分上存在明显差异，松花蛋蛋白质含量较高但维生素B族损失较多，鸭蛋则保留更完整的维生素和矿物质。
松花蛋经过强碱加工后，蛋白质分解为更易吸收的小分子肽类，钙镁等矿物质含量提升，但维生素B1、B2几乎完全流失。蛋黄中形成的松花纹路是蛋白质变性产物，含少量硫化氢成分。鸭蛋未经强碱处理，保留完整的卵磷脂、维生素A、D、E及B族维生素，铁锌等微量元素生物利用率更高，胆固醇含量略低于松花蛋蛋黄。
松花蛋钠含量可达鸭蛋3倍以上，不适合高血压人群长期食用，其碱性加工过程会破坏蛋壳膜导致铅渗透风险。鸭蛋的卵黄高磷蛋白更利于儿童神经系统发育，蛋清中的溶菌酶具有天然抗菌作用。两者均含优质蛋白，但松花蛋的硫氨基酸比例更接近人体需求模式。
建议健康人群交替食用两种蛋类，松花蛋每周不超过3枚，食用时可搭配醋中和碱性。鸭蛋更适合生长发育期儿童、孕妇及术后恢复人群，溏心鸭蛋需确保煮沸8分钟以上。两类蛋品都应存放在阴凉避光处，松花蛋开封后需冷藏并在24小时内食用完毕。
