艾草油对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、白色念珠菌、绿脓杆菌等常见致病菌具有抑制作用，其抗菌作用主要与挥发油中的桉叶素、樟脑等成分有关。
艾草油对金黄色葡萄球菌的抑菌效果显著，该菌可能引起皮肤感染或食物中毒，临床可配合使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等外用抗菌制剂。
艾草油能抑制部分大肠杆菌菌株生长，该菌常导致胃肠炎或尿路感染，治疗时可选用诺氟沙星、蒙脱石散等药物控制症状。
艾草油对白色念珠菌有一定抑制作用，这类真菌可能引发口腔或阴道念珠菌病，临床常用克霉唑栓、制霉菌素片进行抗真菌治疗。
艾草油对绿脓杆菌的抗菌活性较弱，该菌易导致烧伤创面或呼吸道感染，严重时需使用哌拉西林他唑巴坦、环丙沙星等抗生素。
使用艾草油需注意浓度控制，避免直接接触黏膜，出现感染症状应及时就医进行病原学检测。
