苯丙酮尿症患者通过早期诊断和终身饮食控制，多数可达到接近正常人的预期寿命，生存时间主要与治疗依从性、并发症管理、基因突变类型、营养监测等因素有关。
1、治疗依从性：严格限制苯丙氨酸摄入是核心治疗手段，需终身坚持特殊配方奶粉及低蛋白饮食，定期监测血苯丙氨酸浓度，依从性差可能导致智力损伤等不可逆损害。
2、并发症管理：未控制者易出现癫痫、智力障碍、行为异常等神经系统并发症，需通过神经科干预及康复训练减轻损害，及时处理并发症可显著改善预后。
3、基因突变类型：PAH基因突变严重程度影响酶活性残余量，经典苯丙酮尿症需更严格管理，部分轻度突变型患者对饮食限制要求相对较低。
4、营养监测：定期评估生长发育指标及微量元素水平，避免营养不良或代谢失衡，需由遗传代谢病专科医生与营养师共同制定个体化方案。
新生儿筛查确诊后立即启动治疗，家长需严格遵循医嘱进行饮食管理，定期复查血尿代谢指标，成年患者应持续接受代谢门诊随访。
