病毒性脑干脑炎潜在并发症主要有脑水肿、呼吸衰竭、心律失常、多器官功能障碍综合征。
1、脑水肿病毒侵犯脑干可能导致细胞毒性或血管源性脑水肿，表现为剧烈头痛、喷射性呕吐，需使用甘露醇、呋塞米等脱水降颅压药物，配合头部低温保护。
2、呼吸衰竭延髓呼吸中枢受损易引发中枢性呼吸衰竭，患者出现呼吸节律异常，需及时气管插管机械通气，必要时使用呼吸兴奋剂如尼可刹米。
3、心律失常脑干网状结构受累可导致窦性心动过速、室性早搏等心律失常，需持续心电监护，静脉注射胺碘酮或利多卡因控制心律。
4、多器官功能障碍炎症反应过度激活可能引发全身炎症反应综合征，需早期进行血液净化治疗，同时给予乌司他丁等炎症介质抑制剂。
患者应绝对卧床休息，维持水电解质平衡，康复期可进行高压氧治疗促进神经功能恢复，定期复查脑电图和脑脊液指标。
