母乳喂养的健康足月宝宝通常无须额外补充益生菌。母乳本身含有天然益生元和益生菌，能够帮助宝宝建立健康的肠道菌群。
母乳中的低聚糖成分可作为益生元促进双歧杆菌等有益菌生长，而初乳和成熟乳中均含有活性乳酸菌。对于无腹泻、便秘、肠绞痛等消化道问题的宝宝，肠道菌群会随母乳喂养自然达到平衡状态。若宝宝出现抗生素相关性腹泻、牛奶蛋白过敏继发肠炎或早产儿喂养不耐受等情况，可在医生指导下选择特定菌株的益生菌制剂，如双歧杆菌三联活菌散、酪酸梭菌二联活菌散或布拉氏酵母菌散。
哺乳期母亲需保持饮食均衡，避免过度消毒喂养器具以保护宝宝肠道菌群多样性。
