幽门螺旋杆菌经过规范的以两种抗生素，质子泵抑制剂以及铋剂共四联为主的疗法。经过10到14天的治疗，一个月后再复查，基本上85%以上的患者都可以一次性根除。有极少部分患者可能存在耐药，或被其他一部分幽门螺杆菌感染的患者再次传染后，一次根除治疗可能没有完全根除，或者再被感染，但可以再有补救的方案，或者半年后再来一次进行根除。临床经验显示，有些轻度幽门螺旋杆菌感染的患者用药治疗效果不是很好，有的患者吃完药物后复查反而比原来更高，所以类似这种患者不一定要进行根除，除非患者胃镜检查有胃粘膜的萎缩，肠化生或者有溃疡，甚至是肿瘤的患者。
