女性安全期并非绝对安全，不建议在安全期射精在阴道内，仍有意外妊娠的风险。
安全期避孕法依赖于对女性月经周期的推算，通常认为在月经来潮前七天和月经结束后八天属于相对不易受孕的阶段。这个方法的理论基础是避开排卵期，卵子在排出后仅能存活一到两天，而精子在女性生殖道内可存活两到三天。但女性排卵受到多种因素影响，情绪波动、环境改变、疾病或药物作用都可能导致排卵时间提前或延后。即使周期一向规律的女性，也可能出现意外排卵的情况。计算安全期需要准确记录至少六个月的月经周期，找出最长和最短周期，才能估算出排卵日和安全期范围。对于月经周期不规律的女性，安全期计算会更加困难，意外妊娠的概率也会相应增加。
除了排卵时间的不确定性，精子在女性体内的存活时间也增加了安全期避孕的风险。精子进入女性生殖道后，可以在宫颈粘液的保护下存活数天。如果排卵时间发生轻微偏移，存活着的精子仍有可能与卵子结合。一些女性在安全期内也可能有少量卵泡发育并意外排卵。激素水平的轻微变化、精神压力或身体疲劳都可能干扰正常的排卵过程。依靠安全期避孕的夫妻需要密切观察宫颈粘液的变化和基础体温的升高，这些体征能更准确地提示排卵时间，但需要长期坚持记录和仔细辨别。
建议采用更可靠的避孕方式，如避孕套、口服避孕药或宫内节育器，这些方法的避孕效果更为确切。如果选择安全期避孕，应当结合多种判断方法，同时准备紧急避孕措施以应对可能发生的意外情况。定期进行妇科检查，了解自身生理周期特点，保持健康的生活方式，都有助于提高避孕的成功率。任何避孕方法都存在失败的可能，如果出现月经延迟或其他妊娠迹象，应及时进行早孕检测并咨询专业医生。
