生殖器疱疹的治疗方法如下：DC免疫靶向修复治疗体系：科学家们通过基因工程找出病毒DNA的特定基因片段，合成可以针对性切取该基因片段的碱基序列，也就是生物学上我们所说的限制性内切酶。利用限制性内切酶切除病毒DNA病变的基因片段，融入正常的人体基因序列，经过灭活处理形成载体病毒。将载体病毒导入到受HPVHSV病毒感染的病变细胞的细胞核内，完成基因重组，重组后的细胞具有病毒特性，可以快速识别病毒细胞，我们称之为特异性细胞。特异性细胞在体外大量培殖，达到一定数量后通过太空导向技术植入人体。利用特异性细胞本身对病毒细胞较强的识别能力和记忆机制，激活机体内大量的免疫因子，诱发免疫反应，同时产生大量的吞噬细胞，杀灭病毒的同时建立永久的机体免疫机制，拒绝复发。
对于生殖器疱疹的治疗，一般性治疗，治疗还不能彻底清除病毒，也不能阻止疾病的复发。治疗的目的主要是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程及防止继发感染等。目前治疗分一般性治疗、抗病毒治疗及中医中药治疗，这些治疗都是必要的。一般性治疗事实上是对症治疗，而抗病毒治疗是对因治疗，中医中药治疗多通过辨证施治，标本兼治，有效地阻止复发。
