光子嫩肤的科学原理是利用强脉冲光选择性作用于皮肤组织，通过光热效应和光化学效应改善皮肤问题。
光子嫩肤的核心技术是强脉冲光，其波长范围通常为500-1200纳米，可覆盖血红蛋白、黑色素和水分子等多种色基的吸收峰。当特定波长的光能被皮肤中的靶组织吸收后，会产生三种主要作用机制：血红蛋白吸收540-580纳米波长的光能后转化为热能，使异常扩张的毛细血管凝固闭合，从而改善面部红血丝；黑色素吸收550-650纳米波长后发生光热分解，可淡化色斑；而水分子吸收的光能可刺激真皮层胶原纤维和弹性纤维重塑，达到紧致肌肤的效果。设备通过滤光片筛选出特定波段的光谱，配合脉冲宽度、能量密度等参数的精确调控，能实现表皮保护下的靶向治疗。治疗过程中表皮通过接触式冷却系统保持低温，确保光能主要作用于真皮层而避免表皮损伤。
进行光子嫩肤后需加强防晒，使用SPF30以上的防晒霜并避免日光直射。治疗后24小时内避免使用刺激性护肤品，建议选用含神经酰胺、透明质酸等成分的医用敷料进行修复。治疗间隔周期一般为3-4周，连续3-5次治疗可获得较持久的效果。治疗前后一周应避免服用光敏性药物及进行其他光电类美容项目，有活动性皮肤病或近期暴晒史者应暂缓治疗。