矫正牙齿期间可能会增加蛀牙概率，但并非必然发生。蛀牙风险主要与口腔清洁程度、饮食习惯、矫治器类型等因素有关。
固定矫治器的托槽和弓丝容易滞留食物残渣，若清洁不到位，细菌分解糖分产酸会腐蚀牙釉质。隐形矫治器虽可拆卸，但长期佩戴会形成密闭环境，唾液冲刷作用减弱，同样需加强清洁。矫正期间进食高糖食物频率增加，或饮用碳酸饮料未及时漱口，也会加速龋齿形成。
部分患者因矫治器摩擦导致口腔溃疡，可能暂时减少刷牙力度。某些特殊矫治装置如扩弓器会妨碍舌体自洁作用，增加后牙区清洁难度。青少年矫正患者自律性不足时，夜间口腔细菌繁殖更活跃。
矫正期间应使用正畸专用牙刷、牙缝刷和冲牙器清洁矫治器周围，每餐后及时漱口。避免食用粘性糖果或过硬食物，定期进行专业涂氟。出现白垩色脱矿斑块需及时干预，可选择含氟化亚锡的牙膏如舒适达抗敏修护牙膏辅助再矿化。建议每3个月进行口腔检查，早期发现龋损可进行渗透树脂治疗。