窦性心律不齐是否影响手术需根据具体病情判断。若为生理性窦性心律不齐且无其他心脏异常，通常不影响手术；若合并器质性心脏病或严重心律失常，则可能需术前评估调整。
生理性窦性心律不齐多见于青少年或情绪波动时，与呼吸周期相关，心电图显示心率随呼吸轻微变化。此类情况多属于正常生理现象，不影响心脏泵血功能，麻醉和手术风险较低。术前检查若仅发现单纯窦性心律不齐，无结构性心脏病或血流动力学异常，外科医生与麻醉科评估后通常可正常进行手术。
病理性窦性心律不齐可能伴随心肌缺血、心肌炎、心力衰竭等基础疾病，心电图除心律不齐外还可出现ST段改变、传导阻滞等异常。此类患者手术中可能出现血压波动、恶性心律失常等风险，需通过动态心电图、心脏超声等进一步评估。部分患者需先使用美托洛尔缓释片、胺碘酮片等药物控制心律，或推迟择期手术直至心脏功能稳定。
术前发现窦性心律不齐应完善24小时动态心电图和心脏功能评估，避免剧烈运动及刺激性饮食。术后需加强心电监护，观察有无心悸、胸闷等症状，遵医嘱定期复查心电图。