自体脂肪填充太阳穴凹陷可能出现感染、脂肪液化、血管栓塞、填充不均匀、脂肪吸收过度等危险。该手术需由专业医生操作，术前需评估身体状况并排除禁忌证。
感染是术后较易发生的并发症，多因术中消毒不严格或术后护理不当导致，表现为局部红肿热痛甚至化脓。脂肪液化因移植脂肪未能建立血运而坏死，形成囊肿或硬结，需穿刺抽吸处理。血管栓塞为最严重并发症，脂肪颗粒误入血管可能阻塞视网膜中央动脉或脑血管，导致失明或脑梗。填充不均匀与医生操作技术相关，可能造成双侧不对称或凹凸不平。脂肪吸收过度则因移植脂肪存活率个体差异大，部分患者需多次手术补充。
术后应保持伤口清洁干燥，避免挤压按摩面部，禁止吸烟饮酒至少一个月。恢复期出现持续发热、剧烈疼痛、视力异常等情况需立即就医。选择正规医疗机构及经验丰富的医生可显著降低风险，术前应与医生充分沟通预期效果及可能并发症。术后三个月内避免剧烈运动或高温环境，遵医嘱穿戴弹力头套，定期复查评估脂肪存活情况。
